
Hypothèses et rumeurs sur la disparition de la Minerve
Le dossier de la commission d'enquête avait été classé "Confidentiel Défense" nul ne pouvait plus y avoir accès sans raison de service valable.
Ce silence des autorités allait permettre l'émergence de nombreuses rumeurs sur les causes de la disparition.

Cet article d'un magazine télé de 1968 fait état des premières rumeurs qui commencent à circuler
Ces rumeurs, parfois fantaisistes, furent amplifiées par le fait que ceux qui avaient eu accès au dossier le disaient« vide » et qu'il ne comprenait aucune information sensible ou intéressante. Ce qui semblait contradictoire avec le statut « Confidentiel Défense ».
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La Marine ne voulait pas rendre ses erreurs publiques
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Les causes de l'accident ont été cachées pour des raisons d'intérêts économiques et commerciaux
Cette thèse est celle développée par le Monde en 2000 et régulièrement reprise depuis par d'autres quotidiens (voir page Polémiques).
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La Minerve aurait été en mission secrète
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L'équipage était incompétent à commencer par son commandant
Cette hypothèse a surtout circulé dans les milieux militaires. À titre personnel la veuve du commandant a très souvent été attaquée sur ce point et il lui est arrivée de quitter violemment des dîners ou elle avait été conviée suite à de telles accusations. La soeur du commandant et épouse d'un officier de marine a du aussi y faire face.

Le LV André Fauve à l'Ecole Navale en 1967
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L'équipage toujours en vie, capturé par les russes était détenu au goulag en Sibérie.
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La Minerve avait été victime de la défaillance d'un nouveau type d'armement nouveau qu'elle testait.
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La Minerve avait été coulée par les algériens lors d'une opération secrête au large de la base de Mers El Kébir en Algérie que la France venait de restituer à l'Algérie.
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La Minerve aurait été victime d’un tir accidentel d’un missile "Malafon" à partir de la Galissonière où ils étaient en cours d’expérimentation.
Le journal de bord de ce navire précise pourtant que le bateau était amarré, à quai à Toulon ce jour là.

Journal de borde de la Galissonière le 27/01/1968
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L'épave aurait été localisée par les américains au début des années 1980
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Des OVNI, intervention extra-terrestre...